「瑜伽」は「ゆが」と読みます。
https://www.facebook.com/haruhisa.yuga
「瑜」はJIS第2水準ですが、この漢字を用いた苗字はこれだけです。
濁点のつかない「ゆか」を発見しました。
全体をみると「ゆが」の方が多いので変更はしませんが。
https://www.facebook.com/yasunori.sunny.yuka
似た苗字で「偸伽」もあります。
「偸」もJIS第2水準で、この漢字を用いた苗字はやはりこれだけです。
https://repository.kulib.kyoto-u.ac.jp/items/17a7f94c-45a7-4357-8725-5d49c304d528
こちらはローマ字で「yuga」となっています。
他に読みの根拠となるものが見つからなかったので、こちらも「ゆが」の可能性はあるのかなと思います。
「瑜伽」が元で「偸伽」は誤記の定着なのかなと考えました。